惠州市第二妇幼保健院始建于1974年，前身是惠州市妇幼保健所、惠州市妇幼保健院，2009年更名为惠州市第二妇幼保健院，2016年与原惠城区人口和计划生育服务站合并成立惠州市第二妇幼保健计划生育服务中心，2017年成为广东省妇幼保健院紧密型医联体，2018年成为广东医科大学附属惠州妇女儿童医院，是隶属惠城区政府的非营利性公立医院，现已发展成为一所集预防、医疗、保健、科研和教学于一体的三级妇幼保健院，是惠州市医保合作医疗定点单位，惠州市艾滋病母婴阻断试点单位，广东省爱婴医院，广东省唯一承担中国/联合国人口基金第五周期，第六周期国家项目任务工作单位。
医院位于西湖之畔、苏居之滨，总占地面积约 1.6 万平方米，建筑面积约 5.5 万平方米，现有上排总院区、上排时代分院区、江北分院、南坛分院四个院区，编制床位500 张。
现有在岗人员 780多人。
2019 年服务门急诊患者近 84 万人次、收治患者近2.5万人次、助产分娩近 1.1 万人，医院综合实力在全国县区级妇幼保健院中排名前 20 之列。
医院学科优势突出，专业特色明显，技术力量雄厚。目前医院与美国太平洋医疗中心合作建立全国首家“中美产科培训（惠州）基地”，并同时拥有5个市级医学重点专科—妇科、产科、新生儿科、儿科、临床护理，其中新生儿科重症患儿抢救和早产儿救治水平达市内领先水平；设有广东省新生儿护理抢救中心惠州市分中心、广东省新生儿疾病筛查中心惠州分中心、广东省妇幼保健院乳腺病防治中心惠州分中心等一批省市技术协作中心以及生殖医学中心（惠州市除中心医院外第二个能够提供辅助生殖技术和试管婴儿项目的特色中心）、产前诊断中心、儿童听力筛查管理和诊断中心（惠州市首家）、中医康复科、小儿神经内科、心理科、小儿外科等一批特色专科，形成了孕产保健及高危孕产妇救治、危重新生儿抢救、小儿外科、儿科危重症救治、宫颈疾病及妇科肿瘤筛查和治疗、乳腺癌防治、出生缺陷综合防治与产前诊断、儿童保健、中医康复等成熟、规范的健康服务体系，目前正开展多项地区领先的特色服务，是广东省普通高等医学院校教学医院、暨南大学医学研究生培养基地、广东省妇幼保健院规培协同基地。
医院始终秉承“拼搏、奉献、开拓、进取”的院训和“道行健、术精湛、志弘毅、习勤勉”的核心价值观，坚持“以保健为中心，以保障生殖健康为目的，保健与临床相结合，面向基层，面向群体和预防为主”的妇幼卫生工作方针，坚持“母亲安全，儿童优先”的服务宗旨，充分发挥临床与保健相结合的办院特色，围绕“孕产保健部、妇女保健部、儿童保健部、计划生育技术服务部”四大部提供全方位的全生命周期保健服务，促使医院的特色品牌及影响力不断扩大，曾先后荣获“全国先进模范职工之家”、“全国巾帼文明岗”、“全国三八红旗集体”、“国家级母婴友好医院”、“国家级青年文明号”、“广东省五一劳动奖状”等荣誉，为保障广大妇女儿童群体健康作出了积极的贡献。
